Перевозки в интересах дочерних обществ и организаций ПАО «Газпром» осуществляются в соответствии «Порядком организации авиационного обслуживания ПАО „Газпром“, его дочерних обществ и организаций», утверждённым Приказом ПАО «Газпром» от 19.08.2015 №479 и составляют самую большую долю среди других перевозок.
Ежегодно ООО Авиапредприятие «Газпром авиа» заключает договоры на перевозку более чем с двадцатью корпоративными заказчиками.
Перевозки в интересах дочерних обществ и организаций ПАО «Газпром» в основном осуществляются на воздушных судах RRJ-95LR-100 и Boeing-737-700.
Основными направлениями перевозок являются районы добычи и транспортировки углеводородого сырья (Ямбург, Бованенково, Новый Уренгой, Надым, Югорск, Белоярский, Ноябрьск, Талакан, Екатеринбург, Ухта, Сургут, Томск, Тюмень, Оренбург, Благовещенск) и места проведения культурно-массовых мероприятий и детского отдыха (Анапа, Геленджик, Симферополь, Сочи и другие).